Sekretariát Európskej komisie schválil 2. júna 2025 registráciu Paneurópskej vysokej školy v európskom Transparency Register.
Register transparentnosti je databáza „zástupcov záujmových skupín“ (ako sú organizácie, združenia, skupiny a samostatne zárobkovo činné osoby), ktorí vykonávajú činnosti s cieľom ovplyvňovať politiku a rozhodovací proces Európskej únie. Jeho cieľom je informovať verejnosť o tom, aké záujmy sú zastupované na úrovni EÚ, kto ich zastupuje a v koho mene, ako aj o zdrojoch vyčlenených na tieto činnosti
Registrácia Paneurópskej vysokej školy platí pre prípadné členstvo a účasť v skupinách, na podujatiach a brífingoch a aj prístup do priestorov Európskeho parlamentu, Rady Európskej únie, Európskej komisie, Európskeho hospodárskeho a sociálneho výboru a Európskeho výboru regiónov v súvislosti s akademickými vzdelávaním a praxou v oblasti vysokoškolského vzdelávania, praxe, vedy a výskumu v odboroch práva, kultúry, médií, ekonómie a informatiky. Medzi už registrovanými inštitúciami a univerzitami možno nájsť University of Cambridge, Ghent University, Karlova univerzita, European University Association a ďalšie.